MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 2696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017431	GCC	2	6	4	9	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017431	TGC	2	6	63	68	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017431	ATT	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017431	CGA	2	6	97	102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017431	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017431	TAT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017431	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017431	GAA	2	6	286	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017431	AGA	2	6	315	320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017431	AGA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017431	CAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017431	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017431	TTG	2	6	585	590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017431	CTC	2	6	614	619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017431	GAT	2	6	676	681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017431	GAT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017431	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017431	ATG	2	6	793	798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017431	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017431	CCT	2	6	952	957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017431	CTT	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017431	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017431	TGA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017431	A	6	6	1203	1208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017431	AAG	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017431	TGG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017431	CTT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017431	T	7	7	1247	1253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017431	A	6	6	1258	1263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017431	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017431	T	6	6	1639	1644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017431	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017431	T	7	7	1661	1667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017431	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017431	A	6	6	1733	1738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017431	GCA	2	6	5055	5060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017431	A	6	6	5066	5071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017431	AGA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017431	CAAAAA	2	12	6250	6261	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017431	GGAG	2	8	6304	6311	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017431	CTT	2	6	6360	6365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017431	TATG	2	8	6953	6960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017431	GA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017431	A	6	6	7011	7016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017431	TATTT	2	10	7032	7041	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017431	ATG	2	6	7237	7242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017431	A	6	6	9130	9135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017431	TTC	3	9	9175	9183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017431	ATC	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017431	A	6	6	9215	9220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017431	GAA	2	6	9229	9234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017431	A	6	6	9285	9290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017431	TATT	2	8	9309	9316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017431	CCT	2	6	9330	9335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017431	AG	3	6	9351	9356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017431	TAG	2	6	11193	11198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017431	AGAA	2	8	11203	11210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017431	CTT	2	6	11243	11248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017431	TA	3	6	11249	11254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017431	TCA	2	6	11280	11285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017431	TA	3	6	13340	13345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017431	ATT	2	6	13374	13379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017431	AAG	2	6	13391	13396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017431	TTA	2	6	13417	13422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017431	AAGG	2	8	13439	13446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017431	AAG	2	6	13451	13456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017431	AAC	2	6	13535	13540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017431	TA	4	8	13564	13571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017431	CTT	2	6	14958	14963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017431	CAAA	2	8	16073	16080	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017431	AG	3	6	17516	17521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017431	GA	3	6	17529	17534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017431	GTT	2	6	17631	17636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017431	AGA	2	6	18377	18382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017431	AAT	3	9	18439	18447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017431	CT	3	6	18451	18456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017431	TCT	2	6	18467	18472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017431	TGCG	2	8	18527	18534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017431	CTT	3	9	19893	19901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017431	T	6	6	19900	19905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017431	T	6	6	19907	19912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017431	A	8	8	20389	20396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017431	A	6	6	20405	20410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017431	GAA	2	6	20418	20423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017431	A	6	6	20480	20485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017431	AG	3	6	20517	20522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017431	A	6	6	20555	20560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017431	GGA	2	6	20612	20617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017431	AGA	3	9	20652	20660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017431	GA	3	6	20675	20680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017431	TGG	2	6	20871	20876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017431	AAC	2	6	20910	20915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017431	AGC	2	6	20927	20932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017431	GCCA	2	8	21021	21028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017431	TGA	2	6	21128	21133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017431	AG	3	6	21192	21197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017431	TCC	2	6	21245	21250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017431	CT	3	6	21261	21266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017431	CGCT	2	8	21269	21276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017431	TTAA	2	8	21290	21297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017431	GTTA	2	8	21327	21334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017431	GATC	2	8	21382	21389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017431	AAT	2	6	21421	21426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017431	A	7	7	24561	24567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017431	TTA	2	6	24574	24579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017431	T	9	9	24589	24597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017431	GA	3	6	26513	26518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017431	CT	3	6	26520	26525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017431	ACT	2	6	26528	26533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017431	A	6	6	26544	26549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017431	T	7	7	26556	26562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017431	T	7	7	27870	27876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017431	TAA	2	6	27881	27886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017431	TC	3	6	27888	27893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017431	ATTG	2	8	27939	27946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017431	AG	3	6	27971	27976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017431	AGA	2	6	27993	27998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017431	AAAGA	2	10	33093	33102	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017431	CTG	2	6	33122	33127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017431	GA	3	6	36385	36390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017431	T	9	9	36419	36427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017431	CTT	2	6	36479	36484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017431	AT	3	6	36487	36492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017431	CT	3	6	38754	38759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017431	TAA	2	6	38817	38822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017431	T	6	6	38837	38842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017431	AAG	2	6	38858	38863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017431	A	8	8	40115	40122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017431	CT	3	6	40125	40130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017431	T	6	6	40130	40135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017431	CTC	2	6	40136	40141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017431	AAG	2	6	40221	40226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017431	T	8	8	40311	40318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017431	CT	3	6	42317	42322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017431	TGCAA	2	10	42328	42337	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017431	A	6	6	42582	42587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017431	GA	5	10	42592	42601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017431	A	7	7	42631	42637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017431	CAAAA	2	10	42646	42655	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017431	A	7	7	42652	42658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017431	GAT	2	6	42676	42681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017431	AAG	2	6	42682	42687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017431	AG	3	6	42716	42721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017431	A	6	6	42722	42727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017431	GGA	2	6	42734	42739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017431	TAA	2	6	42832	42837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017431	TC	3	6	43808	43813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017431	TGTT	2	8	43817	43824	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017431	A	8	8	43856	43863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017431	AATA	2	8	44056	44063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017431	ACT	2	6	44064	44069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017431	AAG	2	6	45915	45920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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